《魔法少女奈叶The MOVIE 1st》围绕少女高町奈叶展开。某一天，奈叶在森林中偶然捡到了神秘的魔导器「尤诺」，由此知晓了异世界的存在和魔法的秘密。尤诺告诉奈叶，有一些名为「宝石之源」的碎片散落在地球上，若不及时回收，会引发危险。奈叶决定帮助尤诺回收这些碎片，在这个过程中，她结识了同样拥有魔法能力的菲特·泰斯特罗莎。两人从最初的对手逐渐成为并肩作战的伙伴。在回收「宝石之源」碎片的冒险里，她们遭遇了各种强大的敌人和艰难的挑战。奈叶不断成长，魔法能力也日益强大，最终成功回收所有碎片，化解了危机，同时收获了珍贵的友情。[收起部分]
